La fusion des licences recherches MATLAB entre le LRM et BMBI est effective.

La fusion des licences recherches MATLAB entre le LRM et BMBI est effective.

MATLAB est disponible en version 2009b en téléchargement sur DILER et il est installé sur le cluster MATRICS.

J'en profite pour rappeler qu'il faut calculer sur les noeuds du cluster et non sur le frontral matrics.utc.fr, meilleure méthode : utiliser SGE.

Pour les aficionados de MATLAB, voici les licences disponibles :

MATLAB:35
SIMULINK:7
Control_Toolbox:5
Curve_Fitting_Toolbox:7
Data_Acq_Toolbox:1 license issued

Filter_Design_Toolbox:1 license issued

Fuzzy_Toolbox:2
GADS_Toolbox:5
Image_Acquisition_Toolbox:3
Image_Toolbox:5
Neural_Network_Toolbox:1 license issued

Optimization_Toolbox:10
Distrib_Computing_Toolbox:2
PDE_Toolbox:4
Signal_Toolbox:20
Spline_Toolbox:2
Statistics_Toolbox:4
Symbolic_Toolbox:10
Identification_Toolbox:2
Wavelet_Toolbox:3

nouvelles licences, séminaire jeudi prochain

De nouvelles licences flottantes sont disponibles sur DILER, bien que toutes les images CD ne le soient pas encore !

-2 licences ANSYS Research (illimitée en taille de modèle) + 5 HPC (autorisant un calcul sur 6+5CPU au plus). Ces licences sont permanentes.

-5 licences MSC.PATRAN (import IGES + export Marc/Nastran seulement), 5 licences MSC.MARC et 5 licences MSC.MENTAT. Ces licences sont permanentes.

Les licences ont été financées et mises et commun sur PILCAM2 (sous les règles habituelles) par :

-Le LRM pour 1 ANSYS Research, poursuivant une stratégie de développement de l'outil.

-Manu Lefrancois et Benoît Eynard pour 1 Ansys Research, que l'équipe PILCAM remercie chaleureusement pour cette licence mise en commun dans le cadre d'une thèse qui débute.

-MC Hobatho et BMBI pour les produits MSC, BMBI avec qui le LRM opère un rapprochement significatif sur la mise en commun des licences et qui accède désormais les licences ABAQUS du LRM. De même, nous sommes entrain de fusionner les licences permanentes MATLAB du LRM et de BMBI.

J'en profite pour parler un peu de la stratégie générale maintenant :

-PILCAM2 est une plateforme commune (ce qui a justifié le financement du PPF). Partager le hardware c'est bien, mais partager aussi le software, c'est indispensable pour rester cohérent.

-La mise en commun permet de baisser les coûts d'exploitation et d'augmenter le pool de licences, c'est donc d'intérêt commun.

-Nous avons également étendu cette initiative à l'enseignement avec pour l'Apprentissage et l'UTC la mise en commun des 25 licences ANSYS Teaching et pour l'UTC les jetons ALTAIR de la suite Hyperworks. L'Apprentissage a financé la maintenance des 25 licences ANSYS Teaching, permettant d'obtenir la V12 avec notamment 25 FLUENT et 25 AUTODYN enseignement, et le département GSM a financé la maintenance annuelle pour ALTAIR.

Sinon, SCOOP : un nouveau wiki vient d'ouvrir, http://nexstor.wikispaces.com/, celui du futur système de stockage et de sauvegarde de PILCAM2 qui s'appellera NEXSTOR. Plus de news prochainement...

Enfin, n'oubliez pas le séminaire sur PILCAM2 que nous donnons avec Piotr le 19 novembre en H224 à 14H30, ce sera l'occasion de planter une foire aux questions.

@+ pour de nouvelles news,

Benjamin HAGEGE, Maître de Conférences
UTC / Centre de recherches de Royallieu
Département Génie Mécanique
BP 20529, 60205 Compiègne cedex
France
Bureau H304

Comment citer PILCAM2 dans vos travaux scientifiques ?

Une nouvelle page sur le wiki de PILCAM2

citer Pilcam2

explique comment citer la plateforme dans vos articles et communications; vous êtes invités également à y déposer les liens vers ces travaux; soyez nombreux !

Séminaire PILCAM2 le 19 Novembre 2009

Dans le cadre des séminaires du Laboratoire Roberval, une session spéciale sera consacrée à la présentation de nos moyens de calcul. Ce séminaire animé par Benjamin Hagège et Piotr Breitkopf aura lieu le jeudi 19 Novembre. Vous trouverez les réponses à toutes les questions que vous n'avez jamais osées demander !

Matlab 2009b opérationnel

Matlab 2009b est désormais disponible sur les machines du cluster et en téléchargement sur diler pour installer sur votre station de travail personnelle.

Décodage : Mathworks propose deux mises à jour de Matlab par an - "a" au printemps et "b" à l'automne, donc 2009b signifie "automne 2009".

ANSYS version 12 est opérationnel

Bonsoir, bonne rentrée !

Comme des nouveaux thésards arrivent, cela rime parfois avec nouvelles recherches. Aussi je me permets de vous annoncer qu'ANSYS version 12 est opérationnel sur le cluster MATRICS et le serveur COSINUS. L'archive du DVD est bien sûr téléchargeable sur DILER pour une installation sur PC.

Comme nouveauté, il y a notamment le développement important de la partie CFD (mécaflu) avec l'arrivée de FLUENT unifié avec CFX et CFD-POST (anciennement CFX-POST). De plus, le code explicite AUTODYN est désormais aussi disponible ! Pour finir, WORKBENCH a été sévèrement amélioré (existe seulement en version PC pour l'instant).

Les nouvelles commandes sous Linux sont dispo ici : http://diler.wikispaces.com/Alias

Enfin, pour ceux qui veulent rester en version 11, ça marche toujours.

Bien cordialement,

Benjamin HAGEGE, Maître de Conférences
UTC / Centre de recherches de Royallieu
Département Génie Mécanique
BP 20529, 60205 Compiègne cedex
France
*******
Bureau H304

SGE - comment soumettre un job parallèle MPI ?

voici quelques observations de Benoit que nous nous permettons de diffuser en complément à la doc publié sur le wiki de matrics :

Bonjour,

voila quelques news concernant sge et après quelques investigations, voila ce que j'ai compris :
-il existe différents "environnements", (qconf -spl, pour les lister et qconf -sp nom_env; pour voir les détails). mpich n'a rien à voir avec l'implémentation de mpi. Il s'agit d'un environnement qui distribue les calculs en parallèle sur chaque nœuds jusqu'à ce qu'il soit chargé complément.

qstat -t, bien pratique pour voir sur quel nœud/queue tournent les calculs (évite les tops)

j'ai pu lancer un job sur 32 noeuds (pour tester) mais, certains cas ne passaient pas. Le job était "running" mais rien ne se passait. J'ai constaté en regardant le fichiers
job.oID et job.poID que cela se produisait à chaque fois que cosinus était impliqué.
L'astuce que j'ai trouvé : rajouter -l hostname=matrics* pour ne lancer que sur les noeuds matrics001-016. Depuis plus de problème....

Benoit

ps : le pourcentage > 100 correspondaient bien à du calcul multi-threads (% proc utilisé par le processus). C'est ca qui faisait ramer le job. Ca fait une forme de court circuit avec mpi qui tente d'appliquer la règle de base étant 1 coeur / 1 processus. Enfin c'est ma compréhension du truc. Maintenant ca dépote.

ps2 : serait - il possible de "réparer" ganglia pour qu'on puisse visualiser l'activité des noeud 010 à 016 car ils ne sont pas actualisés.

solveur creux parallèle MUMPS disponible !

Bientôt sur ce blog vous vous pourrez lire le message de Banoit Nennig concernant son dernier exploit - l'installation de MUMPS !!!!!!!!!

Ouverture d'ANSYS (enseignement) par le Laboratoire Roberval vers toute l'UTC

Après la suite Hyperworks d'ALTAIR, c'est au tour d'ANSYS (enseignement) d'être ouvert du Laboratoire Roberval vers toute l'UTC.

C'est donc bon pour l'upgrade des licences ANSYS Academic Teaching Introductory de la V11 (que Benjamin Hagège a négociées l'année dernière) vers la V12 que nous partagerons officiellement avec l'enseignement !

Ces licences sont strictement limitées à l'enseignement (pas de recherche / contrat) et à 512k noeuds en fluide / 32k noeuds en méca. Pour les aspects recherche / contrat, contacter Benjamin Hagège, on a une licence prévue à cet effet au LRM.

Pour mémoire, l'UTC détiendra à vie, par l'intermédiaire du LRM, 25 tâches simultanées de :

-ANSYS Classic ou WORKBENCH (version "user friendly" et plateforme commune de pré/post à tous les solveurs), le tout en multiphysique (mécanique, thermique, électricité, électromag, fluide par éléments finis avec flotran, le tout couplé...)

-AUTODYN solveur explicite (crash, mise en forme, explosions...),

-FLUENT ou CFX, les deux solveurs de mécaflu du top 3 du monde de la CFD,

-ICEM CFD, logiciel de maillage analogue à Hypermesh ou I-Deas.

Plus d'infos ici : http://www.ansys.com/products/ansys12-new-features.asp

Le fichier de licence sera sur DILER, le serveur de licences de la plateforme PILCAM2.

Merci aux collègues de l'Apprentissage pour le financement de cet upgrade (1900EHT) qui, peu importe le prix, atteste avant tout d'un esprit de collaboration en interne sain et rafraîchissant.

Voilà une bien belle opération pour l'UTC, à tout point de vue. N'hésitez pas a relayer cette information, l'unification des moyens et des logiciels de calcul doit être non seulement promue, mais également connue de tous.

Licences ABAQUS

Elles sont de nouveau dispo et opérationnelles !

fin de l'intervention sur les noeuds de matrics

le hard des noeuds de matrics (matrics001 à matrics010) a été mis à jour pour permettre leur gestion par kvm sur IP; le switch kvm "physique" a reçu le câble manquant - tous les serveurs sont désormais visibles à partir de l'écran en salle machine

Licences ABAQUS

de la part de Benjamin Hagège :

Les licences ABAQUS sont de nouveau dispo et opérationnelles !

Premier article PILCAM2

Le premier article de revue scientifique citant PILCAM2 sera récompensé !

la nature de la récompense reste pour l'instant secrète, mais le concours est ouvert

Vi: Search and Replace

Eh oui, à l'heure de WISYWIG omniprésent, l'éditeur vi reste toujours irremplaçable pour éditer des fichiers système. Voici un extrait de la formidable doc de Felix Gers :

Search (Wraped around at end of file):

Search STRING forward :   / STRING.
Search STRING backward:   ? STRING.
Repeat search:   n
Repeat search in opposite direction:  N  (SHIFT-n)

Replace: Same as with sed, Replace OLD with NEW:

First occurrence on current line:      :s/OLD/NEW
Globally (all) on current line:        :s/OLD/NEW/g
Between two lines #,#:                 :#,#s/OLD/NEW/g
Every occurrence in file:              :%s/OLD/NEW/g

licences

-les licences abaqus vont tomber le 10 mars, on doit passer le bon de commande mais on risque d'avoir du retard. On aura 25 jetons cette fois-ci (et non plus 23). Il est possible qu'on soit sans licences quelques jours.

-SYSWELD, logiciel par EF dédié au soudage notamment, est dispo avec deux licences en version Win32 et Linux64 jusqu'en octobre 2009, merci à Jean-Marc Roelandt pour cette mise en commun.

-Radioss et Optistruct tournent enfin sur SCALAR.

-MATLAB2008b est bien opérationnel sur toutes les machines (sauf SCALAR), je redonne l'info puisque je vois que beaucoup utilisent encore l'ancienne version dont le serveur de licence se trouve sur Santenay. Bien sûr, cette ressource est aussi importante puisqu'elle héberge des licences également achetées.

Premier job sur 128 processeurs de matrics !

le premier job parallèle utilisant les 128 coeurs de MATRICS sous Open MPI vient de passer !

il s'agit du test d'un algorithme d'optimisation évolutionnaire sous dakota :

-bash-3.2$ mpirun -np 128 -machinefile hostfile dakota -i dakota_rosenbrock_ea_opt.in

cosinus sous Windows Server 2003

Le noeud cosinus.utc.fr (193.55.117.207) à haute capacité mémoire (32GB) à été rebooté sous Windows Server 2003.

5 utilisateurs peuvent se connecter simultanement avec l'utilitaire "Bureau à distance" (Tous les programmes -> Accessoires -> Comunications -> Accès bureau à distance) de Windows.

Sous Mac OSX c'est "Remote desktop connection".

Le client linux reste à explorer...

tous les noeuds sont désormais disponibles

Les noeuds 5 et 6 ont été livrés ce qui porte la capacité de matrics à 128 coeurs

message de bienvenue

Bienvenu dans le blog PILCAM2 ;

Le projet de la plateforme interlaboratoire de calcul intensif de l’UTC démarre enfin avec l’arrivée du cluster.

Les sites wiki suivants ont été crées à l’intention des utilisateurs de la plateforme :

http://pilcam2.wikispaces.com ;
http://matrics.wikispaces.com ;
http://diler.wikispaces.com ;
http://scalar.wikispaces.com .

Avant le redémarrage des activités au semestre de printemps, nous vous invitons à consulter et surtout à contribuer à ces sites collaboratifs.